Towarzystwo Naukowe Organizacji i Kierownictwa zostało założone w kwietniu 1925 roku jako Instytut Naukowej Organizacji - jedna z pierwszych tego typu organizacji na świecie. Jego założyciel, profesor Karol Adamiecki, był pionierem teorii organizacji, twórcą teorii harmonii. Karol Adamiecki był także, obok H. Hoovera i T. Masaryka, założycielem Światowej Rady Zarządzania (World Management Council - CIOS). Działalność statutowa Instytutu obejmowała działalność popularyzatorską, szkoleniową, naukowo-badawczą oraz wydawniczą.

        W czerwcu 1933 roku organizacja uzyskała samodzielność i osobowość prawną, jednocześnie zmieniła nazwę na Instytut Naukowy Organizacji i Kierownictwa. W tym kształcie funkcjonowała do wybuchu II wojny światowej we wrześniu 1939 roku.

        Już w pierwszym kwartale 1945 roku wznowiono działalność Instytutu i kontynuowano realizację jego podstawowych zadań. W 1948 roku zarejestrowano nowy statut i zmieniono nazwę na Towarzystwo Naukowe Organizacji i Kierownictwa. Po kilkuletniej przerwie spowodowanej warunkami politycznymi, w 1957 roku wznowiono działalność Towarzystwa, rozszerzając jego aktywność o działalność gospodarczą.

        W roku 1968 dokonano istotnych zmian w statucie, związanych m. in. ze zmianą zasad rekrutacji członków oraz utworzeniem nowych organów władz, co w istotny sposób wpłynęło na otwartość stowarzyszenia. Zaktywizowano również działalność szkoleniową. W drugiej połowie lat siedemdziesiątych położono nacisk na ilościowy rozwój Towarzystwa, co zmieniło dotychczasowy jego charakter.

        Od 1981 roku Towarzystwo włączyło się w reformowanie gospodarki i państwa, podejmując na nowo działalność w zakresie doradztwa organizacyjnego.

        W latach dziewięćdziesiątych proces transformacji gospodarczej oraz perspektywa integracji z Unią Europejską stworzyły nowe szanse rozwoju dla TNOiK.

        W grudniu 2000 roku TNOiK został uhonorowany medalem Tadeusza Kotarbińskiego przyznawanym przez Komitet Nauk Organizacji i Kierownictwa w dziedzinie organizacji i zarządzania.